Mi occupo di bioinformatica algoritmica, e di algoritmi e strutture dati per stringhe. Quella degli algoritmi per stringhe è un'area classica dell'informatica, che di recente ha avuto nuove e importanti applicazioni nell'ambito di bioinformatica. Stringhe e sequenze, cioé dati di forma testuale, appaiono ovunque nella vita quotidiana (sequenze biologiche, pagine web, email, libri elettronici, sequenze musicali, ecc.)
Mi interessano le soluzioni applicabili a dati biologici, ma molti modelli studiati hanno importanza anche per l'area della combinatorica delle parole e nell'ambito della ricerca teorica su stringhe/sequenze.
Parte della mia ricerca si è concentrata su vari problemi algoritmici che si presentano nell'interpretazione di dati di spettrometria di massa di campioni biologici. Un'altra area di cui mi sono occupata è quella della definizione di distanze tra sequenze non basate su allineamento, e le loro applicazioni allo studio di sequenze genomiche di tipo EST e di sequenze ottenute con le nuove tecnologie nanopore.
Sono autrice di numerosi articoli apparsi in prestigiose riviste internazionali (es. Bioinformatics, TCS, Algorithmica) ed in atti di convegni internazionali di riferimento nella mia area di ricerca. Sono inoltre regolarmente membro dei comitati scientifici di alcune tra le principali conferenze internazionali nell'area della ricerca algoritmica in bioinformatica (WABI), e string matching ed information retrieval (CPM, SPIRE, IWOCA).
Insegnamenti attivi nel periodo selezionato: 36.
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Di seguito sono elencati gli eventi e gli insegnamenti di Terza Missione collegati al docente:
Argomento | Descrizione | Area di ricerca |
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Algoritmi su stringhe | Algoritmi e strutture dati per stringhe e sequenze; strutture dati di indicizzazione per stringhe e sequenze; pattern matching esatto, pattern matching approssimato, misure di distanza tra stringhe, compressione dati; problemi computazionali in biologia, web data, dati testuali, dati musicali; combinatoria delle stringhe, combinatoria delle parole. |
Ingegneria del Software e verifica formale
Design and analysis of algorithms |
Bioinformatica algoritmica | Sviluppiamo algoritmi per problemi discreti in biologia computazionale, quali l'interpretazione dei dati di spettrometria di massa, il clustering di dati trascriptomici, misure di distanza tra sequenze non basate su allineamento. |
Bioinformatica e informatica medica
Life and medical sciences |
Titolo | Data inizio |
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Novel Methodologies and Tools for Next Generation Cyber Ranges - NOMEN | 21/05/24 |
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