Rosalba Giugno

rg,  6 maggio 2016
Qualifica
Professore ordinario
Settore disciplinare
INFO-01/A - Informatica
Settore di Ricerca (ERC-2024)
LS2_11 - Bioinformatics and computational biology

PE6_13 - Bioinformatics, bio-inspired computing, and natural computing

PE6_6 - Algorithms and complexity, distributed, parallel and network algorithms, algorithmic game theory

Settore di Ricerca (ERC)
LS2_10 - Bioinformatics

Ufficio
Ca' Vignal 2,  Piano 1,  Stanza 83
Telefono
+39 045 802 7066
E-mail
rosalba|giugno*univr|it <== Sostituire il carattere | con . e il carattere * con @ per avere indirizzo email corretto.
Pagina Web personale
https://infomics.github.io/InfOmics/

Orario di ricevimento

giovedì, Ore 11.30 - 12.30,   Ca' Vignal 2, piano 1, stanza 83

Curriculum
  • pdf   CV-EN   (pdf, en, 492 KB, 04/11/23)
  • pdf   CV-IT   (pdf, it, 209 KB, 04/11/23)

Rosalba Giugno è Professore Ordinario di Informatica presso il Dipartimento di Informatica dell'Università di Verona. Ha conseguito la Laurea in Informatica presso l'Università di Catania nel 1998 con Lode. Ha conseguito il Dottorato di Ricerca in Informatica presso l'Università di Catania nel 2003. Per il suo programma di dottorato ha trascorso tre anni di ricerca all'estero, presso l'Università del Maryland, la New York University e la Cornell University (NY). È referente del Master in Medical Bioinformatics. È PI del laboratorio InfoOmics dell'Università di Verona. Da quando si è trasferita a Verona nel 2016, guida un gruppo di ricerca composto da 5 dottorandi e diversi studenti di tesi di laurea magistrale. La sua ricerca è focalizzata su algoritmi per grafi e reti biologiche, integrazione e analisi di dati biomolecolari, modellazione di sistemi biologici per la medicina personalizzata. È autrice di 130 pubblicazioni scientifiche, 70 su riviste internazionali. È editor di Information Systems. Ha partecipato a diversi progetti nazionali ed europei, anche con partner industriali. Fa parte del comitato scientifico di congressi e scuole internazionali. Dal 2017 al 2022 è stata Direttore del laboratorio Infolife composto da 35 gruppi di ricerca denominati "nodi", che fanno capo ad altrettante Unità di Ricerca delle Università italiane. 

Insegnamenti

Insegnamenti attivi nel periodo selezionato: 23.
Clicca sull'insegnamento per vedere orari e dettagli del corso.

Corso Nome Crediti totali Online Crediti del docente Moduli svolti da questo docente
Dottorato in Informatica MultiOmics Patien Stratification (2025/2026)   3   
Dottorato in Informatica Multi Omics Patient Stratification (2024/2025)   3  eLearning
Laurea magistrale in Medical bioinformatics [LM-18] Multi-omics single-cell analysis (2024/2025)   6  eLearning
Laurea magistrale in Medical bioinformatics [LM-18] Programming for bioinformatics (2024/2025)   12  eLearning (Teoria)
(Laboratorio)
Laurea magistrale in Medical bioinformatics [LM-18] Multi-omics single-cell analysis (2023/2024)   6  eLearning
Laurea magistrale in Medical bioinformatics [LM-18] Programming for bioinformatics (2023/2024)   12  eLearning (Teoria)
(Laboratorio)
Dottorato in Informatica Attività didattica dottorato (2022/2023)   50  eLearning
Laurea magistrale in Medical bioinformatics [LM-18] Multi-omics single-cell analysis (2022/2023)   6  eLearning
Laurea magistrale in Medical bioinformatics [LM-18] Programming for bioinformatics (2022/2023)   12  eLearning (Laboratorio)
(Teoria)
Laurea magistrale in Medical bioinformatics [LM-18] Programming for bioinformatics (2021/2022)   12  eLearning (Laboratorio)
(Teoria)
Laurea magistrale in Medical bioinformatics [LM-18] Programming laboratory for bioinformatics (2020/2021)   12  eLearning (Teoria)
(Laboratorio)
Laurea magistrale in Medical bioinformatics [LM-18] Programming laboratory for bioinformatics (2019/2020)   12  eLearning (Teoria)
(Laboratorio)
Laurea magistrale in Medical bioinformatics [LM-18] Programming laboratory for bioinformatics (2018/2019)   12  eLearning (Laboratorio)
(Teoria)
Laurea magistrale in Medical bioinformatics [LM-18] Programming laboratory for bioinformatics (2017/2018)   12  eLearning 12 
Laurea magistrale in Medical bioinformatics [LM-18] Programming laboratory for bioinformatics (2016/2017)   12  eLearning 12 
Laurea in Bioinformatica [L-31] Riconoscimento e recupero dell'informazione per bioinformatica (2016/2017)   12  eLearning (Teoria)

Di seguito sono elencati gli eventi e gli insegnamenti di Terza Missione collegati al docente:

  • Eventi di Terza Missione: eventi di Public Engagement e Formazione Continua.
  • Insegnamenti di Terza Missione: insegnamenti che fanno parte di Corsi di Studio come Corsi di formazione continua, Corsi di perfezionamento e aggiornamento professionale, Corsi di perfezionamento, Master e Scuole di specializzazione.

Gruppi di ricerca

Algoritmi in Bioinformatica e Calcolo Naturale
Applicazione di metodi teorici e di analisi dati per modellare l’informazione sottostante ai processi biologici: algoritmi su grafi e stringhe per la biologia dei sistemi; strutture dati avanzate per sequenze di dati; misure di distanza tra sequenze biologiche; calcolo naturale (biotecnologico, e a membrane), riconoscimento di pattern, e apprendimento automatico da dati biomedicali.
INdAM - Unità di Ricerca dell'Università di Verona
Raccogliamo qui le attività scientifiche dell'Unità di Ricerca dell'Istituto Nazionale di alta Matematica INdAM presso l'Università di Verona
InfOmics
La nostra ricerca mira ad analizzare i dati biomedici in modo efficiente, in particolare sviluppiamo nuovi metodi per estrarre reti biologiche, integrare dati eterogenei, analizzare omici, ricostruire pangenomi, analizzare genomi consapevoli dell'aplotipo e classificare i pazienti. Utilizziamo la teoria derivante dall'apprendimento automatico, dalla scienza dei dati, dalla matematica e dalla teoria dei grafi.
Competenze
Argomento Descrizione Area di ricerca
Active learning Nell'apprendimento attivo, il modello interroga iterativamente un oracolo (tipicamente un annotatore umano) per etichettare solo i punti dati più informativi che contribuiscono maggiormente a migliorare l'accuratezza del modello. In questo modo, l'apprendimento attivo riduce il costo dell'etichettatura e accelera il processo di apprendimento del modello. Questo approccio è particolarmente utile quando i dati etichettati sono scarsi o costosi da ottenere. La ricerca si concentra sullo sviluppo di criteri di selezione efficaci per identificare i punti dati più informativi da etichettare, migliorando così l'efficienza del processo di apprendimento attivo. Intelligenza Artificiale
Machine learning
Apprendimento non supervisionato È un approccio in cui i modelli vengono addestrati su dati non etichettati, con l'obiettivo di identificare schemi o strutture nascoste all'interno dei dati senza etichette predefinite. Viene comunemente utilizzato per compiti come il clustering, la riduzione della dimensionalità dei dati e il rilevamento delle anomalie. La ricerca aperta nell'apprendimento non supervisionato si concentra sul miglioramento della capacità di scoprire strutture significative in insiemi di dati complessi e ad alta dimensione, spesso con conoscenze preliminari limitate. Le sfide principali includono lo sviluppo di algoritmi di clustering più efficaci, il miglioramento dell'interpretabilità dei modelli che scoprono strutture latenti e la gestione di alti livelli di rumore o scarsità nei dati. Inoltre, sono in corso lavori per colmare il divario tra l'apprendimento non supervisionato e altri paradigmi, come l'apprendimento semi-supervisionato, auto-supervisionato e per contrasto, e per migliorare la robustezza dei modelli non supervisionati nelle applicazioni reali. Intelligenza Artificiale
Machine learning
Apprendimento supervisionato È un approccio in cui i modelli vengono addestrati su dati etichettati per apprendere una mappatura dagli input agli output, consentendo loro di prevedere etichette corrette per nuovi dati non visti. Sebbene sia ampiamente utilizzato per compiti come classificazione, regressione e predizione di serie temporali, la ricerca attuale in questo campo affronta diverse sfide. Tra le questioni principali, si annoverano come rendere i modelli più robusti al rumore e alle incongruenze delle etichette, migliorare l’efficienza dei campioni per ridurre la necessità di grandi set di dati etichettati e abilitare un "trasferimento" di conoscenza (transfer learning) efficace tra compiti e domini diversi con dati etichettati limitati. Inoltre, affrontare problematiche di equità e bias nei modelli supervisionati, così come migliorare la scalabilità per gestire grandi set di dati senza compromettere le prestazioni, oltre che approcci basati su attenzione/transformer restano aree di ricerca attive. Intelligenza Artificiale
Machine learning
Bioinformatics and Natural Computing La nostra ricerca è focalizzata sui punti seguenti: 1) Analisi discreta e algoritmica di dinamiche biologiche (metabolismo, replicazione e loro rapporti nei processi cellulari), 2) Analisi informazionale e computazionale di genomi (dizionari genomici, indici genomici, distribuzioni di parametri, rappresentazione di genomi, sintesi e ricostruzione di genomi). In queste aree di ricerca sono sviluppati, teorie, algoritmi e software per esperimenti e analisi computazionali. Bioinformatica e informatica medica
Life and medical sciences
Biologia Computazionale Analizzare efficacemente i dati biomedici sviluppando metodi innovativi per l'estrazione di reti biologiche, l'integrazione di dati eterogenei, l'analisi dei dati omici, la ricostruzione di pan-genomi, l'analisi dei genomi considerando gli aplogruppi, la previsione del riposizionamento dei farmaci e delle combinazioni terapeutiche, l'individuazione dei trattamenti ottimali e l'implementazione di strategie avanzate per la classificazione e la stratificazione dei pazienti. Sistemi informativi ed analisi dei dati
Computational Biology
Deep learning Si focalizza sull'addestramento di reti neurali profonde, ovvero con numerosi strati, per apprendere automaticamente pattern e rappresentazioni da grandi quantità di dati. Utilizzando architetture come le reti neurali convoluzionali (CNN) per le immagini, le reti neurali ricorrenti (RNN) per i dati sequenziali e i transformer per compiti diversi, l'apprendimento profondo eccelle in compiti complessi come il riconoscimento delle immagini, l'elaborazione del linguaggio naturale, il riconoscimento vocale, il reinforcement learning, la predizione di serie temporali e la guida autonoma. Intelligenza Artificiale
Machine learning
Systems Biology, Computational Network Biology Progettazione di algoritmi e metodi per lo studio di sistemi biologici utilizzando tecniche bioinformatiche e di data mining. L'attenzione è rivolta alla modellazione, alla perturbazione e all'analisi delle reti biologiche; classificazione dei fenotipi mediante profili di espressione codificanti e non; la sinergia dei farmaci e il meccanismo di azione di farmaci-target e off-target. Bioinformatica e informatica medica
Life and medical sciences
Progetti
Titolo Data inizio
PREPARE - Personalized Engine for Prostate cancer Evaluation 01/07/23
JP2019 - Una piattaforma per lo sviluppo di applicazioni di intelligenza artificiale basata su analisi intelligente di video per attività commerciali di ristorazione con servizio al tavolo 01/10/20
EDIPO: A computational solution for bringing neuroimaging genetic into translational research 01/04/20
ADAIR - Dall'inquinamento atmosferico all'inquinamento cerebrale: nuovi biomarcatori per capire il legame tra inquinamento atmosferico e morbo di Alzheimer 01/01/20
Genomica e metagenomica nell’area di ricerca industriale del settore agroalimentare. 16/04/19
Distributed Optimization for Large-scale Statistical Modeling 26/02/19
Sviluppo di una piattaforma computazionale per la tracciabilità di microrganismi nei processi agroalimentari utilizzando marcatori brevettati HPME 01/09/18
Genomica e metagenomica nell’area di ricerca industriale del settore agroalimentare 29/08/18
JP2018 - Analisi e progettazione piattaforma per il supporto alle decisioni (DSS) ad alte prestazioni per la diagnosi di malattie oculari 09/03/18
vEyes Wear: piattaforma hardware e software indossabile aperta 15/01/18
Analisi computazionale di patologie genomiche 01/10/17
JP2016 - PREDYCOS: Una piattaforma reattiva per un sistema complesso che sia personalizzato e dinamico 10/07/17
Modelli computazionali ad alte prestazioni per l'estrazione l ‘integrazione di informazioni biomediche 01/01/17
InfoGenAgriFood: piattaforma bioinformatica integrata nella genomica della produzione agroalimentare 01/09/16
Integrazione di basi di conoscenza di reazioni avverse spontanee nazionali e internazionali per la scoperta di modelli nella farmacovigilanza 01/01/16




Organizzazione

Strutture del dipartimento

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