Giuditta Franco

Foto,  5 maggio 2010
Qualifica
Ricercatore
Settore disciplinare
INF/01 - INFORMATICA
Settore di Ricerca (ERC)
PE6_13 - Bioinformatics, biocomputing, and DNA and molecular computation

Ufficio
Ca' Vignal 2,  Piano 1,  Stanza 72
Telefono
+39 045 802 7045
Fax
+39 045 802 7068
E-mail
giuditta|franco*univr|it <== Sostituire il carattere | con . e il carattere * con @ per avere indirizzo email corretto.

Orario di ricevimento

giovedì, Ore 9.30 - 11.30,   Ca' Vignal 2, piano 1, stanza 72

Curriculum

Laureata in Matematica a Pisa (2001), GF ha conseguito il dottorato in Informatica, con una tesi intitolata “Biomolecular Computing - Combinatorial Algorithms and Laboratory Experiments”, a Verona (2006), dove attualmente afferisce come ricercatrice universitaria a tempo indeterminato, dopo diversi contratti e assegni di ricerca presso l’università di Pisa (sia al dipartimento di matematica che in quello di informatica, 2001-2003), l’università di Verona (sia al dipartimento di informatica che al centro di ricerca CBMC, 2003-2007) e all’estero (sia al LIACS, Leiden Institute of Advanced Computer Science, in Olanda, e al dipartimento di Matematica della USF, University of South Florida, USA, 2005-2006). Ha trascorso diversi soggiorni internazionali, in particolare negli Stati Uniti (presso la USF e presso l’università SUNY a Binghamton) and in Olanda (at LIACS), e ha maturato un’esperienza di sperimentazione biotecnologica tramite alcuni stages in laboratori di biologia molecolare (sia al dipartimento di Biotecnologia che in quello di patologia generale all’università di Verona, e al dipartimento di scienze biologiche all’università di Binghamton , NY, USA).
 
Si occupa di ricerche che spaziano tra la matematica discreta e l'informatica teorica, con particolare interesse su i) progettazione di modelli computazionali di sistemi biologici e processi metabolici, ii) progettazione e implementazione di algoritmi di calcolo biomolecolare, iii) proprietà computazionali di operazioni su stringhe DNA e analisi informazionale di genomi; iv) progettazione di modelli su dati immunologici e di bioreattori. Ha lavorato sull'analisi informazionale di sequenze DNA e sulla modellazione dinamica, mediante sistemi a membrane e analisi di serie temporali multivariate, di processi immunologici e di processi di rimarginazione di tessuti cellulari. Risultati recenti riguardano sia un modello dei cambiamenti legati all’età della rete di B cellule umane, che uno di evoluzione di popolazioni batteriche. Ha portato avanti una ricerca incentrata sullo studio analitico e sperimentale (in laboratori di biologia molecolare) di algoritmi biomolecolari, col risultato di aver individuato nuovi metodi di estrazione e ricombinazione di DNA, scoperto funzionalità informazionali e computazionali nei principi che caratterizzano la struttura del DNA, e introdotto nuovi modelli teorici per la generazione di strutture tridimensionali di DNA tramite il noto processo di "self-assembly”. Su questo e altro ha coautorato circa 50 articoli scientifici, alcuni dei quali pubblicati su riviste come Mathematical Biosciences, TCS, Natural Computing, Biosystems, BMC Genomics, The Journal of Logic and Algebraic Programming, e partecipato come relatrice a circa 30 congressi internazionali, con una ventina di presentazioni su invito.
 
Prende parte a PC di diverse conferenze, e serve come revisore diversi giornali internazionali, tra cui quelli dell’American Mathematical Society. Frequentemente offre consulenze scientifiche alla commissione europea (EC) come revisore di progetti europei. Ha un paio di esperienze come co-editrice di giornali internazionali, una lunga esperienza di attività didattica (2002-2020), che include la supervisione e il tutoraggio di tesi e stages di studenti, sia in Italia che all’estero.


 

Insegnamenti

Insegnamenti attivi nel periodo selezionato: 21.
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Corso Nome Crediti totali Online Crediti del docente Moduli svolti da questo docente
Laurea in Bioinformatica Metodi informazionali (2020/2021)   6  eLearning
Laurea magistrale in Medical bioinformatics Natural computing (2020/2021)   6  eLearning
Dottorato in Informatica Attività didattica dottorato (2019/2020)   50  eLearning
Laurea magistrale in Medical bioinformatics Natural computing (2019/2020)   6  eLearning
Laurea magistrale in Medical bioinformatics Natural computing (2017/2018)   6   
Laurea in Bioinformatica Metodi informazionali (2016/2017)   6   
Laurea magistrale in Medical bioinformatics Natural computing (2016/2017)   6   
Laurea magistrale in Bioinformatica e biotecnologie mediche Modelli di calcolo naturale (2015/2016)   6   
Laurea magistrale in Bioinformatica e biotecnologie mediche Modelli di calcolo naturale (2014/2015)   6  eLearning
Laurea magistrale in Mathematics Mathematical methods for computer science (2013/2014)   6   
Laurea in Bioinformatica Modelli biologici discreti (2013/2014)   6   
Laurea in Bioinformatica Modelli biologici discreti (2012/2013)   6   
Laurea in Bioinformatica Modelli biologici discreti (2011/2012)   6   
Laurea in Bioinformatica Modelli biologici discreti (2010/2011)   6   
Laurea specialistica in Biotecnologie molecolari e industriali Infobiotica (2009/2010)   4   
Laurea in Bioinformatica Modelli biologici discreti (2009/2010)   6   
Laurea specialistica in Biotecnologie molecolari e industriali Infobiotica (2008/2009)   4   
Laurea in Bioinformatica (ordinamento fino all'a.a. 2008/09) Modelli biologici discreti (2008/2009)   5   
Laurea in Bioinformatica (ordinamento fino all'a.a. 2008/09) Algoritmi e strutture dati (2007/2008)   10    Laboratorio
Laurea specialistica in Biotecnologie molecolari e industriali Infobiotica (2007/2008)   4   
Laurea specialistica in Biotecnologie molecolari e industriali Infobiotica (2006/2007)   4   

 

Gruppi di ricerca

Algoritmi in Bioinformatica e Calcolo Naturale
Applicazione di metodi teorici e di analisi dati per modellare l’informazione sottostante ai processi biologici: algoritmi su grafi e stringhe per la biologia dei sistemi; strutture dati avanzate per sequenze di dati; misure di distanza tra sequenze biologiche; calcolo naturale (biotecnologico, e a membrane), riconoscimento di pattern, e apprendimento automatico da dati biomedicali.
Bioinformatica e Calcolo Naturale
Analisi algoritmica di processi biologici
Competenze
Argomento Descrizione Area di ricerca
Bioinformatics and Natural Computing La nostra ricerca è focalizzata sui punti seguenti: 1) Analisi discreta e algoritmica di dinamiche biologiche (metabolismo, replicazione e loro rapporti nei processi cellulari), 2) Analisi informazionale e computazionale di genomi (dizionari genomici, indici genomici, distribuzioni di parametri, rappresentazione di genomi, sintesi e ricostruzione di genomi). In queste aree di ricerca sono sviluppati, teorie, algoritmi e software per esperimenti e analisi computazionali. Bioinformatica e informatica medica
Life and medical sciences
Biological network dynamics Design and analysis of data-driven computational models, for both metabolic and immunological dynamics, based on grammars ruled by state functions. Biological network dynamical properties are investigated in terms of discrete mathematics and model simulation. Membrane and metabolic computing for biological modeling. Genetic network investigation based on computational genomics studies. Bioinformatica e informatica medica
Life and medical sciences
Computational genomics and DNA computing Investigation and classification of genomic sequences by means of information theory based methods. Design and analysis of both bio-inspired and molecular algorithms, along with their lab implementation. Bioinformatica e informatica medica
Life and medical sciences
Progetti
Titolo Data inizio
Modelli simbolici di dinamiche cellulari: algoritmi biomolecolari e sistemi dinamici a membrana - Rinnovo (PRIN 2006) 09/02/07
Modelli simbolici di dinamiche cellulari 01/12/04
Modelli simbolici di dinamiche cellulari: algoritmi biomolecolari e sistemi a membrana. (PRIN 2004) 30/11/04
Algoritmi bio-molecolari per problemi NP completi 21/02/03





Giuditta Franco
Carica Organo collegiale
componente Consiglio del Dipartimento di Informatica - Dipartimento Informatica

Organizzazione

Strutture del dipartimento