Il progetto vuole perseguire la definizione, la sintesi e l'implementazione di metodi, algoritmi e strutture per l'analisi di reti di trasduzione del segnale. Esso si dispiega in tre fasi elencate: estensione di plugin PeSca per il calcolo biomolecolare; sintesi algoritmica e realizzazione di un plugin Cytoscape per l'individuazione di "network motifs"; Sintesi algoritmica e implementazione di un tool per la standardizzazione dei nomi delle proteine. A compendio del buon svolgimento di queste fasi, si conduce una quarta fase di tipo più esplorativo ancorchè fondata su promettenti risultati ottenuti nel'ambito della ricerca portata avanti dall'Unità di ricerca nell'ambito dello studio della dinamica dei processi biomolecolari.