Algoritmi metabolici e problemi di biologia sintetica

Il presente seminario è il primo di una serie che verterà su tematiche di tipo bioinformatico.

ABSTRACT: Dopo una breve introduzione alle diverse prospettive del rapporto tra biologia e calcolo, si introducono alcuni temi di ricerca sviluppati all'interno del gruppo coordinato dal relatore, presso il dipartimento di Informatica negli ultimi cinque anni. In particolare, si presentano le idee fondamentali di una classe di modelli discreti di metabolismi, basati sugli MP sistemi (Metabolic P Systems) e sui relativi algoritmi metabolici. Tali algoritmi permettono l'analisi di dinamiche metaboliche (ma non solo) cercando di superare alcuni limiti dei modelli differenziali, nel contesto di fenomeni biologici complessi. Si delineano quindi i principi del 
metodo Log-Gain per MP sistemi. Infine, si conclude riprendendo alcune questioni sollevate nell'introduzione che si legano a temi emergenti di biologia sintetica.