- Cercare in ENSEMBL la proteina FABP1 e rispondere le domande del esercizio presentato a lezione.

- Cercare in SwissProt la stessa sequenza e analizzare le annotazioni. Salvare in un file di testo la sequenza in formato FASTA.

- Ricerca utilizzando PSI-BLAST (parametri: max sequences: 200) su nr con la sequenza di FABP1. Quanti omologhi a struttura nota ci sono? Fino a quale e-value posso considerare i 'hits' trovati come omologhi?  Cos'è l'E-value?

- Fare un allineamento multiplo con 200 sequenze, ottenute dopo la convergenza di PSI-BLAST (si riesce ad arrivare a convergenza? altrimenti quante iterazioni consiglia di fare?). Visualizzare l'allineamento con JalView.

- Analizzare la struttura della proteina omologa presente in PDB, piu vicina a FABP1 (programma a scelta fra vmd e swisspdb-viewer).

- Utilizzando la versione di Blast che corrisponda, fare la ricerca su una banca dati di EST umani.

- Ci sono dati rilevanti in ArrayExpress riguardanti questo gene?