Algorithms for Single cell data analysis (2021/2022)

Codice insegnamento
cod wi: DT000241
Docente
Rosalba Giugno
Coordinatore
Rosalba Giugno
crediti
3
Settore disciplinare
INF/01 - INFORMATICA
Lingua di erogazione
Italiano
Sede
VERONA
Periodo
A.A. 21/22 dottorato dal 1-ott-2021 al 30-set-2022.

Orario lezioni

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Obiettivi formativi

Gli studenti impareranno tematiche d'avanguardia nel settore del Single cell Analysis e argomenti relativi. Avranno la possibilità di discutere e confrontarsi con alcuni maggiori ricercatori Italiani e internazionali del settore.

Programma

Il corso sarà organizzato in 6 incontri, via zoom (https://univr.zoom.us/j/9174698091). Ad ogni incontro sarà invitato un esperto dell'area di ricerca. Di seguito le date dei primi 4 incontri e le tematiche affrontate. I dottorandi interessati a partecipare dovranno mandare una mail a rosalba.giugno@univr.it entro il 13 Gennaio 2022.

18 Gennaio 16.00-18:00, Speaker: Gary Bader, Developing a cellular ecosystem model of human tissue organization

20 Gennaio 9:00-11:00, Speaker: Davide Risso, Large-scale statistical analysis of single-cell RNA-seq data: normalization, dimensionality reduction, and clustering

25 Gennaio 16:00 -18:00, Speaker: Giuseppe Narcisi, Somatic variant analysis of linked-reads sequencing data with Lancet

26 Gennaio 11:00 -13:00, Speaker: Levi Waldron, Single Cell Multimodal Data Technologies

Testi di riferimento

Vedi la bibliografia dell'insegnamento

Modalità d'esame

I dottorandi che parteciperanno a tutti gli incontri per avere riconosciuto il corso dovranno presentare un seminario con una dimostrazione pratica di uso di un algoritmo/software da concordare con la docente. I dottorandi avranno due mesi di tempo per preparare il seminario.