Informational Genomics: information content of genomes and its divergence from randomness (2020/2021)

Codice insegnamento
cod wi: DT000080
Docente
Vincenzo Bonnici
Coordinatore
Vincenzo Bonnici
crediti
3
Settore disciplinare
INF/01 - INFORMATICA
Lingua di erogazione
Italiano
Sede
VERONA
Periodo
A.A. 20/21 dottorato dal 1-ott-2020 al 30-set-2021.

Orario lezioni

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Obiettivi formativi

Lo studente acquisirà delle nozioni di genomica computazionale legate alla teoria dell'informazione.
In particolare la notione di distribuzione e come essa viene applicata lla analisi dei genomi sarà fondamentale per lo studio del contenuto informativo dei genomi.

Programma

Introduzione al corso. Nozioni base. Genomi come stringhe di DNA.
Distribuzioni. Indici statistici e ineguaglianza di Chebyshev. Distanze tra distribuzioni.
Informazione e sorgenti informative. Dalla entropia fisica a quella informazionale.
Entropia e mutua entropia. Principio circolare dell'entropia. Divergenza entropica.
Genomi come sorgenti informative. Distribuzioni genomiche.
Indici genomici informazionali e relazioni tra di essi.
Genomi random. Principio di log-normalità dei random. Limiti logaritmici delle randomicità.

Testi di riferimento
Autore Titolo Casa editrice Anno ISBN Note
T. M. Cover, J. A. Thomas Elements of Information Theory (Edizione 1) John Wiley & Sons, Inc. 1991 0471062596
Vincenzo Manca Infobiotics Springer 2013

Modalità d'esame

Lo studente dovrà esporre una presentazione riguardante un articolo scientifico affine agli argimenti del corso e che sia stato concordanto con il docente.