HOMECAT per il trasferimento di conoscenza oltre le barriere filogenetiche e bioinformatiche

Comparative studies are encouraged by the fast increase of data availability from the latest high-throughput techniques, in particular from functional genomic studies. Yet the size of datasets, the challenge of complete orthologs findings and not last, the variety of identification formats, make information integration challenging. With HOMECAT we aim to facilitate cross-species relationship identification and data mapping, by combining orthology predictions from several publicly available sources, a convenient interface for high-throughput data download and automatic identifier conversion into a Cytoscape plug-in, that provides both an integration with a large set of bioinformatics tools as well as a user friendly interface.
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Gli studi comparativi sono incoraggiati dal rapido incremento della disponibilità  di dati dalle recenti tecniche high-throughput, in particolare dagli studi di genomica funzionale. Eppure la quantità  dei dati, la necessità  di identificare gli ortologhi e non ultimo, la varietà  dei formati di identificazione, rendono l'integrazione delle informazioni impegnativa. Con HOMECAT ci proponiamo di facilitare l'identificazione di rapporti interspecifici e la mappatura dei dati, combinando le predizioni ortologiche da diverse fonti liberamente accessibili, un comodo accesso a dati high-throughput e la conversione automatica degli identificatori, in un plug-in per Cytoscape. In Cytoscape si realiza l'integrazione con un ampio ventaglio di strumenti bioinformatici tramite un'interfaccia "user friendly".