Reti e sistemi per la bioinformatica (2017/2018)

Codice insegnamento
4S003711
Docente
Davide Quaglia
Coordinatore
Davide Quaglia
crediti
6
Settore disciplinare
INF/01 - INFORMATICA
Lingua di erogazione
Italiano
Periodo
II sem. dal 1-mar-2018 al 15-giu-2018.

Orario lezioni

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Obiettivi formativi

Conoscenza e capacità di comprensione: Gli studenti acquisiranno le nozioni di base per la progettazione, realizzazione, sviluppo, gestione e manutenzione dei sistemi hardware e software presenti in laboratori biotecnologici.

Capacità di applicare conoscenza e comprensione: Gli studenti saranno in grado di sviluppare, gestire e manutenere sistemi informatici, con particolare riguardo all'installazione e all'amministrazione di risorse; utilizzare software di analisi di rete e strumenti informatici in ausilio ai laboratori di biologia e medicina.

Programma

Teoria
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Comunicazione tra sistemi
- Reti
- Protocolli di comunicazione
- Reti di sensori
- Internet delle Cose
- Interazione “macchina-macchina” (M2M)
Tecniche e dispositivi per l'acquisizione, memorizzazione e visualizzazione di dati
- Acquisizione, calibrazione dei sensori, errori di misura
- Formati di memorizzazione
- Dispositivi di memorizzazione di massa
- Lab-on-chip
Metodi per la tracciabilità automatica
- Ambiti applicativi
- Tecnologie di identificazione automatica (Codici a barre, RFID, Etichette wireless attive)
- Standard EPCGlobal
- Architettura del sistema informatico per la tracciabilità automatica

Laboratorio
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- Strumenti software di analisi di rete.
- Programmazione di rete in Java.
- Comunicazione M2M tramite middleware.
- Strumenti di visualizzazione di dati scientifici.
- Esempio di automatizzazione di processo biotecnologico (progetti E-Wine, E-Flour)
- Esempio di automatizzazione di ricerca biotecnologica
- Virtualizzazione di elaboratori e gestione avanzata di un sistema Linux

Sbarramenti: Elementi di Architettura e Sistemi Operativi, Programmazione
Prerequisiti: Basi di dati per bioinformatica

Testi di riferimento
Autore Titolo Casa editrice Anno ISBN Note
John L. Hennessy, David A. Patterson Computer Architecture - A Quantitative Approach (Edizione 5) Morgan Kaufmann 2011 012383872X
C. Hamacher, Z. Vranesic, S. Zaky, N. Manjikian Introduzione all'architettura dei calcolatori (Edizione 1) McGraw-Hill 2012 9788838667510
Andrew S. Tanenbaum Reti di calcolatori (Edizione 4) Pearson - Prentice Hall 2003 8871921828
Abraham Silberschatz, Peter Baer Galvin, Greg Gagne Sistemi operativi. Concetti ed esempi. (Edizione 9) Pearson 2014 9788865183717

Modalità d'esame

Obiettivo dell'esame è quello di accertare la comprensione dei contenuti del corso. Esso consiste di:

1) una prova scritta con 10 domande su teoria e laboratorio; le domande possono consistere anche in brevi esercizi numerici; vengono attribuiti max 3 punti per ciascuna risposta;
2) svolgimento facoltativo di un progetto di tipo:
- bibliografico (max 2 punti, gruppo di max 2 persone)
- sperimentale (max 3 punti, gruppo di max 3 persone)

Gli studenti del Corso di Laurea in Informatica non possono inserire questo esame tra i crediti “a scelta”.

Per il progetto sono possibili sinergie con altri corsi, stage, e tesi.

Il voto finale (in trentesimi) si ottiene sommando il voto della prova scritta al punteggio del progetto. La lode si attribuisce quando si conseguono 32 o 33 punti.

Materiale didattico

Documenti

Opinione studenti frequentanti - 2016/2017